قارچ‌شناسی (به انگلیسی: Mycology) شاخه‌ای از زیست‌شناسی است که با مطالعۀ قارچ‌ها در زمینه‌های شامل خصوصیات ژنتیکی و زیست‌شیمیایی، آرایه‌شناسی، استفاده آن‌ها برای انسان برای مثال در پزشکی (مانند پنی‌سیلین)، خوراک و همین طور خطرهای آن‌ها که باعث مسمومیت می‌شود.سروکار دارد. 
مرکز مطالعات قارچ شناسی ایران و همچنین مجموعه ذخایر ژنتیکی قارچ های ایران در مجموعه تنوع زیستی و ذخایر ژنتیکی موسسه تحقیقات گیاه پزشکی کشور قرار دارد.مسئولیت مجموعه قارچ های ایران پیش از این با دکتر جعفر ارشادی و دکتر مهرداد عباسی بوده و اکنون برعهده آقای دکتر محمدرضا آصف شایان می باشد. 
به طور کلی بخش قارچ شناسی یکی از بخش های آزمایشگاه می باشد که وظیفه آن جمع آوری، بررسی و تشخیص نمونه های مشکوک به لحاظ وجود قارچ های بیماریزا می باشد. علائم و نشانه‌های عفونت قارچی پوست به نوع قارچ و ناحیه درگیر شده بستگی دارد. بثورات قارچی گاهی اوقات با دیگر بیماری‌های پوستی مانند پسوریازیس و اگزما اشتباه گرفته می‌شوند. بیمار‌های قارچی پوست می‌توانند انواعی از بثورات مختلف پوستی را ایجاد کنند. بعضی از آن‌ها باعث ایجاد قرمزی، پوسته پوسته شدن پوست و خارش می‌شوند و بعضی فقط باعث ایجاد خشکی پوست می‌گردند. قارچ‌ها می‌توانند فقط یک منطقه‌ی خاص یا چندین ناحیه از بدن را درگیر نمایند. در این آزمایشگاه بررسی مستقیم و کشت از نمونه های مشکوک به قارچ به عمل می آید.